Dr Agnieszka Pastuła

Nisza komórek macierzystych & mikrośrodowisko nowotworowe

Jestem naukowcem zafascynowanym interakcjami komórkowymi w obrębie niszy komórek macierzystych oraz mikrośrodowiska nowotworowego. Posiadam >15 lat doświadczenia w pracy badawczej. Jestem absolwentką Uniwersytetu Jagiellońskiego, gdzie z wyróżnieniem ukończylam studia magisterskie z biologii. Już podczas studiów magisterskich odbyłam liczne praktyki i staże w laboratoriach w Polsce, jak i za granicą. Ponadto, doświadczenie zawodowe zdobywałam pracując na Collegium Medicum Uniwersytetu Jagiellońskiego, Czeskiej Akademii Nauk w Pradze oraz Helmholtz Zentrum München.

Zafascynowana naukami biomedycznymi odbyłam studia doktoranckie na wydziale medycznym Uniwersytetu Technicznego w Monachium, a następnie wzbogacilam doświadczenie w pracy naukowej wykonując staż postdoktorancki na Umeå University w Szwecji i Columbia University w Nowym Jorku. Po odbytych stażach postdoktoranckich skupiłam się na szukaniu możliwości uzyskania środków finansowych na samodzielną działalność naukową. Moim marzeniem jest zalożenie międzynarodowej grupy badawczej. Moim celem naukowym są odkrycia na temat interakcji komórek nowotworych z mikrośrodowiskiem oraz identyfikacja nowych targetów terapeutycznych mikrośrodowiska nowotworu.

Co się dzieje w naszym jelicie, czyli o kryptach jelitowych i komórkach stromy image

Uważa się, że nasz organizm składa się z ponad 37 bilionów komórek. Komórki to podstawowe jednostki budulcowe naszych tkanek. Komórki w naszym organizmie znajdują się w nieustannej komunikacji. Komórki komunikują się ze sobą na różne sposoby np. za pomocą wydzielanych białek lub mikroskopijnej wielkości pęcherzyków błonowych zwanych exosomami.

Moje zainteresowania naukowe są skierowane na komunikację komórek epitelialnych (nabłonkowych) z komórkami stromalnymi. Komórki epitelialne występują w wielu organach naszego organizmu np. w jelitach, gdzie następuje regularny proces odnawiania tkanki nabłonkowej, co dzieje się dzięki tzw. epitelialnym komórkom macierzystym jelita, komórki te znajdują się w obrębie krypt jelitowych (zagłębienia w tkance nabłonkowej jelita). Fascynujące jest, że w jelicie komórki epitelialne (w tym komórki macierzyste) są ''otulone'' warstwami komórek stromy (Ryc. 1), co wskazuje na zachodzenie interakcji pomiędzy komórkami epitelialnym i komórkami stromalnymi. Jakkolwiek, komórkowe i molekularne mechanizmy tych interakcji są bardzo słabo poznane. Ich lepsze poznanie może nie tylko przyspieszyć postęp medycyny regeneracyjnej, jak też przyczynić się do lepszej diagnozy i leczenia chronicznych chorób jelita np. choroby Leśniowskiego-Crohna czy raka jelita grubego.

Grant Narodowego Centrum Nauki (NCN), Sonata-16, 2021 - 2024
Grant wyjazdowy na konferencję ''United European Gastroenterology (UEG) Week 2019'', Barcelona, Hiszpania
Grant wyjazdowy na konferencję ''Science: Polish Perspectives (SPP) Berlin 2018'', TU Berlin, Niemcy
Nagroda za najlepszy poster, The EMBO Journal Poster Prize, EMBO-EMBL; sympozjum ´´Organoids: Modelling Organ Development and Disease in 3D Culture´´, Heidelberg, Niemcy (2016)
Nagroda za najlepszy poster, Best Poster Prize, konferencja ´´International Cancer Study & Therapy Conference´´, Baltimore, USA (2016)
Dofinansowanie do projektu badawczego (mini-grant badawczy), Forschungsförderung der Dr.-Ing. Leonard Lorenz-Stiftung TUM, Niemcy (2015)
Nagroda za najlepszy poster/fellowship, konferencja ´´7th Mildred Scheel Cancer Conference´´, Bonn, Niemcy (2015)
Nagroda Laura Bassi Award, Uniwersytet Techniczny w Monachium, Niemcy (2015)
Dofinansowanie do projektu badawczego (mini-grant badawczy), Forschungsförderung der Dr.-Ing. Leonard Lorenz-Stiftung, Uniwersytet Techniczny w Monachium, Niemcy (2014)
Nagroda za najlepszą prezentację, 17th International Student Scientific Conference for Students and Young Doctors (ISSC), Gdańsk (2009)
Stypendium Erasmus Scholarship Abroad Program, Utrecht University (2008)
Stypendium Sapere Auso Małopolskiej Fundacji Stypendialnej (2007/2008)
Stypendium naukowe, Uniwersytet Jagielloński (2007/2008)
Stypendium naukowe, Uniwersytet Jagielloński (2005/2006)

Prace recenzowane

Christian J. I.*, Pastula A.*, Herbst A., Neumann J., Marschall M. K., Ofner A., Zierahn H., Schneider M. R., Wolf E., Quante M., Kolligs F. T. Loss of DRO1/CCDC80 in the tumor microenvironment promotes carcinogenesis. Oncotarget. 2022; 13: 615-627. https://www.oncotarget.com/article/28084/text/
Pastuła, A.# and Lundmark, R. (2021). Induction of Epithelial-mesenchymal Transition in MDCK II Cells. Bio-protocol 11(3): e3903. https://bio-protocol.org/e3903
Pastuła, A. & Marcinkiewicz, J. Cellular Interactions in the Intestinal Stem Cell Niche. Arch. Immunol. Ther. Exp. 2018 Sep 21. https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs00005-018-0524-8

Schellnegger R, Quante AS, Rospleszcz S, Schernhammer M, Höhl B, Tobiasch M, Pastula A, Brandtner A, Abrams JA, Strauch K, Schmid RM, Vieth M, Wang TC, Quante M, Goblet-cell ratio in combination with differentiation and stem cell markers in Barrett’s esophagus allow distinction of patients with and without esophageal adenocarcinoma. Cancer Prevention Research. 2016 Nov 2. http://cancerpreventionresearch.aacrjournals.org/content/early/2016/11/02/1940-6207.CAPR-16-0117

Pastuła A, Middelhoff M, Brandtner A, Tobiasch M, Höhl B, Nuber AH, Demir IE, Neupert S, Kollmann P, Mazzuoli-Weber G, Quante M. Three-Dimensional Gastrointestinal Organoid Culture in Combination with Nerves or Fibroblasts: A Method to Characterize the Gastrointestinal Stem Cell Niche. Stem Cells Int. 2016. https://www.hindawi.com/journals/sci/2016/3710836/

Pastuła, A.# and Quante, M. (2014). Isolation and 3-dimensional Culture of Primary Murine Intestinal Epithelial Cells. Bio-protocol 4(10): e1125. https://bio-protocol.org/e1125

Boross P, Jansen JH, Pastula A, van der Poel CE, Leusen JH. Both activating and inhibitory Fc gamma receptors mediate rituximab-induced trogocytosis of CD20 in mice. Immunol Lett. 2012. http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0165247812000065

Pastuła A#, Marcinkiewicz J. Myeloid-derived suppressor cells: a double-edged sword? Int J Exp Pathol. 2011. Artykuł przeglądowy. http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/j.1365-2613.2010.00754.x/full

Tomecki R, Kristiansen MS, Lykke-Andersen S, Chlebowski A, Larsen KM, Szczesny RJ, Drazkowska K, Pastula A, Andersen JS, Stepien PP, Dziembowski A, Jensen TH, The human core exosome interacts with differentially localized processive RNases: hDIS3 and hDIS3L EMBO J. 2010. http://emboj.embopress.org/content/29/14/2342.abstract

* równorzędny pierwszy autor
# autor korespondencyjny

Rozdziały w książkach

Pastuła A, Immunoscore, circulating tumor cells and human-derived organoids as potential predictive tools in personalized cancer medicine; tytuł książki : ´´Medical Ethics, Prediction, and Prognosis. Interdisciplinary Perspectives´´. Wydawca: Routledge, 2017; p. 175 - 185. https://www.routledge.com/Medical-Ethics-Prediction-and-Prognosis-Interdisciplinary-Perspectives/Bondio-Sporing-Gordon/p/book/9781138632691

Pastuła A. Immunoterapia nadzieją w leczeniu nowotworów; tytuł książki: ´´Od prehistorii do współczesności. Różne spojrzenie na zdrowie i medycynę człowieka´´, Wydawnictwo Poligrafia ITS. Kraków 2008, s. 231-235. https://books.google.pl/books/about/Od_prehistorii_do_wsp%C3%B3%C5%82czesno%C5%9Bci.html?id=u8IUuQAACAAJ&redir_esc=y

Artykuły popularnonaukowe

Pastula A. Rola kalikrein w barierze ochronnej organizmu, Alma Mater Jagiellonian University, 64-65, 2016. http://www.almamater.uj.edu.pl/archiwum-2016?p_p_id=56_INSTANCE_Df4E&p_p_lifecycle=0&p_p_state=normal&p_p_mode=view&p_p_col_id=column-1&p_p_col_pos=1&p_p_col_count=2&groupId=2910359&articleId=119819816&page=64

Pastula A. Medycyna spersonalizowana terapią przyszłości w onkologii, Alma Mater UJ, 171-172, 2015. http://www.almamater.uj.edu.pl/archiwum-2015?p_p_id=56_INSTANCE_Df4E&groupId=2910359&articleId=83689196

Pastula A. Relacja z międzynarodowego kongresu 17th International AEK Cancer Congress 20–22 marca 2013 roku, Zeszyty Naukowe Towarzystwa Doktorantów UJ Nauki Ścisłe, Nr 9 (2/2014). https://depot.ceon.pl/handle/123456789/8123

Pastuła A. Innowacyjne sposoby walki z rakiem, Alma Mater UJ, Oct, 107, s. 87-88, 2008. http://www2.almamater.uj.edu.pl/107/19.pdf

Materialy konferencyjne

AM Pastula, KP Janssen, TC Wang, R Schmid, M Quante. Stromal-Epithelial Cross-Talk in the Intestinal Stem Cell Niche is Mediated by a Regulatory Network that Involves TGF-Beta and CTGF. Gastroenterology 152 (5), S350. April 2017. https://www.gastrojournal.org/article/S0016-5085(17)31432-4/abstract

Schellnegger R, Quante AS, Rospleszcz S, Schernhammer M, Höhl B, Tobiasch M, Pastula A, Brandtner A, Strauch K, Schmid RM, Vieth M, Wang TC, Quante M, Becherzelldichte mit Differenzierungs- und Stammzellmarkern bei Barrett-Ösophagus können zur Identifikation von Dysplasie und Adenokarzinom verwendet werden. Zeitschrift für Gastroenterologie 54(08) August 2016. https://www.thieme-connect.com/products/ejournals/abstract/10.1055/s-0036-1587207

Pastula A, Janssen KP, Hauck S, Schmid RM, Quante M. Myofibroblasts induce poorly differentiated tumor-like spheroids in small intestinal organoids by Wnt-independent mechanism. [abstract]. Proceedings of the 107th Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2016 Apr 16-20; New Orleans, LA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2016;76(14 Suppl):Abstract nr 928. http://cancerres.aacrjournals.org/content/76/14_Supplement/928

Pastula, A., Hauck, S., Janssen, K. P., Schmid, R. M., & Quante, M. (2014). 267: Mesenchymal cells regulate growth of intestinal crypts by a Wnt independent mechanism in 3D culture system. European Journal of Cancer, (50), S63. https://www.ejcancer.com/article/S0959-8049(14)50236-5/abstract

Dehmel, S., Pastula, A., Imker, R., Schulz, N., Eickelberg, O., Roscher, A., & Krauss-Etschmann, S. (2011). Late-breaking abstract: Maternal genetic asthma predisposition affects pulmonary microRNA profiles in neonatal offspring. European Respiratory Journal, 38(Suppl 55), p1128. http://erj.ersjournals.com/content/38/Suppl_55/p1128.short

Preprinty
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.10.07.511327v1

Liczba cytowań: 652

2021 - Polish Histochemical and Cytochemical Society (PTHC)

2015 - 2021 American Association for Cancer Research (AACR)

2017 - 2020 American Society for Cell Biology (ASCB)

2015 - 2020 European Association for Cancer Research (EACR)

2015 - 2020 German Cancer Society (Deutsche Krebsgesellschaft, DKG)

2018 - 2019 The New York Academy of Sciences (NYAS)

2017 - 2018 American Gastroenterological Association (AGA)

ORCID https://orcid.org/0000-0002-9103-3419

Google Scholar https://scholar.google.pl/scholar?hl=en&as_sdt=0%2C5&q=pastula+agnieszka&oq=

Procedura izolacji i hodowli krypt jelitowych https://bio-protocol.org/e1125

Test na zakażenie mykoplazmą https://www.lifescience.net/protocols/879/mycoplasma-test/